面板是否覆盖目标人群中的常见和低频等位基因。
TASK DRAWERS
先处理当前任务,再进入研究问题
账号、设备和节点属于使用条件;参考面板、样本重叠和效应差异属于解释条件。两组条件应分别记录。
REFERENCE SHELF
参考面板不是一张静止的名单
HLA填补会受到面板样本量、族群构成、分型精度和基因组版本影响。更换面板以后,不能只比较最终等位基因名称,还要核对输入标记和质量阈值。
阅读HLA参考面板说明输入SNP与参考面板之间是否有足够的重叠。
填补概率和质量阈值是否采用相同口径。
面板、坐标和软件版本必须跟随结果保存。
EFFECT NOTES
同一个方向,不代表同一种效应
研究 A样本条件较一致
研究 B效应方向相同,区间更宽
研究 C异质性需要单独解释
固定效应模型关注共同效应,随机效应模型允许研究间存在差异。模型不是为了挑出更好看的显著性,而是回答不同的问题。
理解荟萃分析共享对照
OVERLAPPING SAMPLES
共享样本会改变统计量之间的关系
多个研究使用相同对照时,汇总统计量不再相互独立。若直接合并,标准误、相关结构和最终功效都可能发生变化。保存样本来源和重叠比例,比事后只看一个P值更有用。
查看重叠样本专题